湖泊、水庫是陸地上水交換過程緩慢的水體.其水體污染有自身的持點。
(1)污染的來源廣，種類復雜。入湖河流攜帶的各種工業(yè)廢水、居民生活污水及湖區(qū)周圍農(nóng)田灌溉水的污染物，湖面降水等面源污染物可進入湖泊。溯中水生動、植物的殘體也可污染湖泊，幾乎湖泊流域環(huán)境中的一切污染物質(zhì)，都可以通討各種途徑進入湖泊。
(2)稀釋、搬運污染物質(zhì)的能力弱。湖泊、水庫水面廣闊，水流遲緩，水交替緩慢，更新期比河流長，一般污染物進入湖泊、水庫后不能迅速混合而達到稀釋。泥沙及污染物易于積累而增多。
(3)湖泊的生物降解、積累和轉(zhuǎn)化污染物質(zhì)的能力強。水生動、植物多且流動緩慢的期水，有利于湖泊水生動、植物對污染物質(zhì)的吸收。水體受污染后，污染物質(zhì)除了直接從水體進入生物體外，還可通過食物鏈中多級生物的吞食，不斷富集和轉(zhuǎn)移。
(4)湖泊、水庫污染的主要現(xiàn)象是富營養(yǎng)化。含大量氮、磷的污水進入后，導致水生生物(主要是藻類)的大量繁殖，藻類的過度生長和死亡及藻類的分解腐敗，可引起湖水變色(水華)、發(fā)臭、溶解氧下降、水質(zhì)惡化。以及魚類和其他水生物大量死亡。而藻類及其他生物殘體的分解，又釋放出氮、磷等背養(yǎng)素，供新一代藻類利用。因此，即使切斷了氮、磷污染的來源，富營養(yǎng)化了的水體也難于自凈和恢復到正常狀態(tài)。
(5)底質(zhì)污染。湖泊特殊的水流特點決定了底泥污染也是導致其水質(zhì)污染的一個重要因素。各種外來污染物主要以懸浮形式存在于湖水中，由于流速的減少，比較終懸浮物沉積于水底，形成底質(zhì)的組成部分。
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